Dans tous les cursus proposés, la formation académique se veut progressive : à partir d’enseignements fondamentaux dispensés en début de formation jusqu’aux matières spécifiques orientées vers l’aéronautique, les systèmes d’armes en service dans l’Armée de l’Air par exemple. Cette formation de l’expert de l’utilisation militaire du milieu aéronautique développe ainsi l’identité de l’aviateur.

Les enseignements théoriques réservent une place importante aux exercices et aux travaux pratiques, avec des ratios entre les cours magistraux et les travaux dirigés et pratiques de l’ordre de 50% dans certains cursus.

Les stages à l’extérieur font également partie intégrante de la formation des étudiants.

L’École de l’Air fait aussi le choix de mettre en œuvre de nouvelles formes de pédagogies actives, contemporaines et adaptées aux profils des étudiants du XXIème siècle. Il s’agit par exemple de l’Apprentissage par Problème et par Projet (APP) ou encore de l’Enseignement À Distance (EAD).